Forum Organizatorów Transportu występuje do instytucji rządowych w sprawach dotyczących organizacji transportu publicznego. W ostatnich latach FOT skierował m.in. do Kancelarii Prezesa Rady Ministrów apel o wsparcie i objęcie branży transportowej mechanizmami osłonowymi z powodu rosnących cen energii elektrycznej i paliw w polskich miastach, do Ministra Infrastruktury prośbę o objęcie ochroną prawnokarną pracowników transportu publicznego – kontrolerów biletowych oraz w sprawie wprowadzenia „Ogólnopolskiego Biletu Zintegrowanego”.